2004年6月2日，41岁的穆里尼奥正式亮相斯坦福桥，在那时，很少有人能够预料到，这个自称“特殊的一个”的葡萄牙人，会在未来三年半的时间里，彻底改变切尔西这家俱乐部的命运，当时的切尔西，尽管有阿布拉莫维奇的巨额投资，然而在英格兰足坛，依然被看作暴发户，是一个靠金钱堆砌却缺少灵魂的土豪俱乐部球迷网，穆里尼奥的到来，不但带来了战术革新，更为重要的是，给这支球队注入了独一无二的精神气质。
穆里尼奥接手那时的切尔西，正处在一个微妙的转型阶段，阿布于2003年夏天入主之后，已然投入了超过一亿英镑，引进了克雷斯波、贝隆、马克莱莱等球星，可是球队一直缺少清晰的战术体系以及比赛风格，前任主帅拉涅利虽说带队拿到了欧冠资格，然而始终没办法把这支豪华之师凝聚成真正的争冠队伍，穆里尼奥上任过后的第一件事情，就是向全队传达一个明确的讯息：我们不是来参与竞争的，我们是来统治英超的。
葡萄牙人的那种铁血意识，迅速地在训练场上面彰了显露；他废掉了常规的热身办法，用高强度战术演练取而代之；他规定每个球员都得参与防守，涵盖技术型的乔·科尔以及罗本；他构建了以特里为核心的防守架构，使马克莱莱充当中场屏障。这些变动在季前赛时就初现效用，切尔西呈现出了前所未有的纪律性与组织性。穆里尼奥特意去营造了一种氛围，那种氛围是“我们对抗全世界”，他告知给球员们，他说：“在英格兰这个地方，所有的人都期望曼联以及阿森纳能够赢球，针对于这种情况，我们一定要凭借着自身的表现去让那些人闭上嘴巴。”
2004年到2005赛季的英超揭幕战，切尔西以1比0的比分小胜曼联，这场胜利奠定了整个赛季的基调，穆里尼奥的球队展现出了惊人的防守稳定性，特里和卡瓦略的中卫组合坚如磐石，马克莱莱在中场的扫荡让对手寸步难行，那个赛季，切尔西创造了多项纪录，单赛季仅失15球，29场零封，主场全胜，他们提前三轮锁定冠军，终结了阿森纳和曼联对英超的垄断，穆里尼奥在锐步球场夺冠后，将金牌扔向看台的画面，成为了英超历史上最经典的瞬间之一。
穆里尼奥的取得成功，不光是构建于战术方面的创新之上，更是发源于他针对球员心理所具备的精准把控能力。他心里清楚德罗巴是需要被激发出斗志的，所以在训练期间特意让后卫对他实施凶狠的犯规动作；他十分明白兰帕德的潜力还没有完全被释放出来，因而就为他量身定制了中场后插上的战术；他察觉到切赫的稳定性对于整支队伍来讲是非常关键的，于是就给予这位年轻的门将毫无保留的信任。这些做法使得切尔西的更衣室形成了一种前所未有的凝聚力，球员们心甘情愿为穆里尼奥竭尽全力。
穆里尼奥有另一大武器是心理战，他称温格是“偷窥癖”，嘲讽贝尼特斯靠伊斯坦布尔奇迹吃这碗饭，暗示弗格森受裁判偏袒，这些言论看着狂妄，实际是精心设计，通过把媒体注意力引到自己这儿，穆里尼奥给球员创造了相对宽松的舆论环境，同时，这种“与全世界为敌”姿态强化了球队内部团结，2005年联赛杯决赛对阵利物浦时，穆里尼奥故意让球员在场上热身长达一小时，目的是打乱对手赛前准备。这种细节处的算计，往往能带来关键的优势。
切尔西在穆里尼奥时期开创了英超球队新运营模式，他秉持“阵容精简且每个位置有两名顶级球员”理念，此轮换策略确保球队多线作战时稳定性，穆里尼奥还是最早重视运动科学的主帅之一，他引入先进体能训练方法与恢复设备，大幅降低球员受伤风险，这些创新使切尔西在竞技层面始终保持领先。
然而，穆里尼奥跟阿布的关系，却渐渐展现出裂痕，俄罗斯老板期望看到更具观赏性的足球，期望引进舍甫琴科这般的巨星，而葡萄牙教头却坚守实用主义的胜利哲学，2006 - 07赛季，伴随成绩波动以及更衣室矛盾的加剧，穆里尼奥最终在赛季初黯然下课，可即便离去，他留下的遗产依旧在持续发酵，特里、兰帕德、切赫等核心球员都深深印上了穆氏的烙印，切尔西的足球DNA已然被彻底改变。
2013年，穆里尼奥重回斯坦福桥，此次回归再度证实其于切尔西历史具有特殊地位，虽二进宫情形未复制首次执教那般灿烂，可仍是给球队带来英超冠军，更关键的是，他再度唤醒蓝军铁血精神，为后续孔蒂、图赫尔等接任者打下根基，即便离开多年后，每当切尔西处于低谷之时，球迷们都会不由自主想起那位在场边充满激情指挥的葡萄牙人。
穆里尼奥对切尔西产生的影响，已超出单纯竞技层面，他将这支以往的“出租车组织”蝶化成堂堂豪门；他造就了切尔西身为英超违抗一方的身份认可；他证实了金钱只有跟确切的足球理念聚合，方可铸就灿烂。于斯坦福桥之荣誉陈列室中矗立的两座英超冠军奖杯固然夺目；然而价值更高的乃是穆里尼奥为这支队伍灌注的那种绝不言弃之心境特质。正是这种特质，令切尔西自打那时起便别具一格。
如今，人们讨论切尔西历史上最重要人物时，阿布是首位投资人，穆里尼奥是把金钱转化为荣耀的魔法师，魔法师用三年半完成改造，改造影响力持续近二十年，从这意义讲，称他为切尔西教父或许不过分，斯坦福桥草皮记得，看台上球迷记得，被他点石成金的球员更记得，那个曾在此创造奇迹的“特殊的一个” 。
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